rarewaresからLAME 3.99.5を落として試してみたが、
-V 0のみデフォルトでローパスが無効になってるみたいだね。
LAMEタグ情報を記録しないようにするコマンド-tを追加して、
「-V 0 -t」と「-V 0 --lowpass -1 -t」でエンコしたファイルを比較すると、バイナリレベルで一致した。