>これに関してはCUIでchown -R apache:apacheを行った時にはエラーはでませんでしたが、
>CentOS7標準のGUIで入ってみて、ディレクトリのプロパティを開くと上記のエラーが出てしまいます。

どういうことです？
chown -R apache:apache
を実行したときはエラーは出ない。その後でディレクトリのプロパティを開くと「指定した"Apache"と言う所有者は存在しません」
が出るということですか？
そういうところはちゃんと書きましょう。

CUIで次の２つのコマンドを実行して、その出力をコピペしててください。
whoami
ls -l /var/www/html/owncloud/