Vistaでスキンを変更しても他のユーザーに反映されないんだけど、
その設定はどこに保存されてるか分かりますか？

他の設定は共通で使えるんだけど。スキンの設定だけがユーザーごとになってるみたい。
（関連付けがユーザーごとは分かるんだけど）