自分でsystemConfigタグをつけたtiddlerを定義してその中に
{{{}}}で設定を書けばいいよ
こんな感じ↓
{{{
config.options.chkAnimate=false;
config.options.chkHttpReadOnly=true;
config.options.chkForceMinorUpdate=false;
config.options.txtMaxEditRows="30";
config.options.txtBackupFolder="backup";
}}}