>>47です

いわゆるゲームリスト機能は存在していませんが、機能は最低限の物だけをONにしています
他ゲーム(スプリンターセル、PAYDAY2、Bethesda製ではFONVなど)は問題なく動作しているので
やはり問題はスカイリムSEそのものにあるかと考えています。

インストール先はCドライブにしています。
再ダウンロードは3回行いましたが、症状は変化しませんでした。