LMMSはLinux上で動作するときLinux VSTiをネイティブで読み込む
そしてWindows VSTiをWineを介して読み込む
他方LMMSはWindows上で動作するときWindows VSTiをネイティブ（>>186の場合はWine）で読み込む

つまりLMMSをLinux上で起動したときWineの呼び出しに失敗しているのでは