ワイモバイルの保証パック入ってなくても、契約状態がNexus 5x端末に紐付いている限り、１年のメーカー保証を過ぎてもブートループはメーカー（LG）が認めている不具合のため、基盤交換は無料とのこと。
昨日ワイモバイルに確認
但し、部品の問題などもあるので５年も６年先までもとかはムリ

ショップ店員がブートループ問題に詳しく、色々と教えてくれた。
なお、修理目安は１週間以内（基盤交換のみなら）他の箇所で不具合がありメーカーから、この不具合も治すと追加がかかると言われても基盤交換のみして下さいと言えば１００％無料