Javascriptで操作はWebブラウザ内に限定される、デスクトップアプリケーションには使えない
自動化スクリプトが欲しいという話だったらUWSC/AutoIt/AHKのいずれか
これらは見たことあるし今も使ってる
より本格的に操作したいっていうならUIオートメーションに行きつく、VoiceroidUtlで使われてるね