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横だけど、確定申告で、A証券は申告する　B証券は申告しないと選べる
なので、儲けが４５万円分出るだけ、他の証券会社に株券を移管して
その証券会社のみ申告すれば、お前さんの心配は無くなる。

あと、譲渡は申告分離だから　399で合ってるはず。
というか、同じサラリーマンで譲渡損失の繰り越ししてプラス分でたことあるけど
住民税上がってなかったよ。特定口座の源泉ありね。