>>266
キーの入れ替え自体は Windows の標準機能であって、
Change Key は GUI でそれをやるフロントエンドみたいなものだね。
だから単純にキーを入れ替えるというなら一番シンプルで確実な手法がそれになる。

AHK を使わなければいけないとしたら、アプリケーションによって入れ替えるキーを変更するとか、
特定キーで入れ替えをトグルするという場合であって、そうでもないなら Change Key の方がスマート。

>>265
知る必要ないと思うけど、スタートアップではなくタスクスケジューラーで AHK を起動させるか、
数秒待った後に AHK を起動するというバッチファイルを用いてそれを実行するとできる。