>>113
どのサイトの動画とコメントを結合(焼きこみ)したいのかわかりませんが、さきゅばすは画面解像度をきちんと設定しないとそうなるようだから、wikiの「ニコニコ動画とコメントをダウンロードして結合する」か「ニコニコ生放送(ニコ生)動画とコメントをダウンロードして結合する」のどっちかの設定のところを参考に
動画設定タブ→変換オプション設定(共通)タブ→共通FFmpeg設定の下のコンボボックスに動画の解像度と同じ設定があればそれを選ぶ。

Youtube動画とコメなら、さきゅばす使わない方法(xml->A/S/S変換)もあるし、Showroom,Twitch,Kick etcなら四八福星間開発さんのところのツールでA/S/S変換から結合するのが速いと思います。