SlNicoLiveRec V1.0.1.2ですが過去のタイムシフトの音ズレ対策のためcopytsをオフにしてますが、そのため逆に以下の条件を満たす放送は必ず音ズレします
1.新サーバーに移行後のユーザー生放送
2.音声の最初にだけblankがある放送（映像にはblankがない）
※映像音声共にblankがある放送は音ズレしません
2.の条件は直接開発ツールかなにかで音声と映像のm3u8を開いてみないとわかりません。

例
lv347549322
lv347108476
lv347232085

公式やチャンネルしか見ない人はこのままでよいと思いますがユーザー放送しか見ないような人はnicolive.pyの以下の部分を False から True に書き換えたほうが良いかと思います。
ffmpeg_options={"copyts": False}