Siki バージョン 0.33.6にしてみましたが、
お気に入りを板で開くを選んだ状態で全ワークスペースの新着レスをチェックをしても未読数の赤丸がつかないです
ウインドウのリフレッシュをすると表示されます
tablistには問題なく表示されます
こちら修正できたら直してもらえるとうれしいです