アニメのモザイクは色情報が少なすぎてjavplayerじゃまともに変換できないよ
3DCGアニメならものによっては　おおっ！　ってなるものもあるけど、
そういうのはほんと一握り。50作品に1つあるかってレベル。2Dは基本的に全部ダメ。

北米版のソース持ってるなら一旦画像をBMPやPNGで吐き出して
Upscale(Degital Artの2倍で良い)とか綺麗に画像処理できるソフトで
再変換して音声と合成し直した方が良い