ずっと前からWindows版Mesen2にある不具合なんだが
OSのサウンド設定でサンプルレートが384000Hzに設定してあると音が一切鳴らない
192000Hzに設定すれば正常に鳴る

まあこれはMesen2がWASAPIではなくいまだに時代遅れのDirectsoundを使用してるのが原因なんだが
開発陣に報告しようにもgithubのissueページが閉じられてるから報告できないっていう