沙羅曼蛇４面ボスのような次のプレイに持ち越されるような明らかに理不尽なものと違って、
ファンタジーゾーンの例は１プレイ内での２周目の難易度アップの要素として筋が通るようなことなんだし、
製作関係者にでも聞かない限り真相はわからない、仕様でもバグでもどちらともとれることとして、
これ以上ここで自分の考えを主張し合っても仕方がないことじゃないか？
移植版が同じになってるってことも、元はバグなんだけどそんな不自然な挙動じゃないから仕様だと思ってそのまま移植してしまったってこともありうるだろ。