それは自動で設定されてるんじゃなくて配置してある物を勝手に読み込んでるだけだから当然ui.iniには書き込まれてないよ
勝手に設定されてると思い込んでる時点でui.ini確認してみ？空欄になってるから

そこからちゃんと設定し直して保存しなけりゃ反映されないのは当たり前