個人的にはcueシートは余りお勧めしないかなぁ
有料ソフトだけどdbpowerampで曲毎の無圧縮flacがいいと思う
私もPCオーディオ始めた時はEACでcue+アルバム丸ごとwavで管理してたけど、途中で無圧縮flacに移行した