アプデチェックに関してはバイナリいじる必要ないと思うよ
ツール → 設定 → 基本 → その他 → 最新バージョンが公開されたら通知する
このチェック外してるけど自分は今のところ初回以外バージョンチェックされてない
逆アセ追ってもバージョンチェックしにjaneのサイトにアクセスしに行ってる気配はない