Goodnotesはほんと扱いやすそうよね使ったこと無いけど
OneNoteはなぁ……便利ではあるけど、元が2003年の設計が古いソフトだからか、現代基準では不便な制限やおかしな不具合、めんどくさい仕様がめっちゃ目立つんだよな……

個人的な経験則では、使い方の情報が集めやすい方を使うといいと思うよ