--app=　で呼び出す時点で　--window-position=　と　--window-size=　が無視されりゅんだわ
"C:\\Program Files (x86)\\Google\\Chrome\\Application\\chrome.exe", "--window-position=0,0 --window-size=500,300", "--app=https://hogenet.jp/hogehoge.html";
ってやってもウインドウサイズは前のバッチファイルで開いた時のサイズと同じ（Preferencesに書いてあるサイズ）