ごめん。自分のほうでmacrium reflectによる復元試した
>>99で言及した使用容量/空き容量の狂いは、復元後の容量には問題なかった。
chkdsk C: /Rの結果もエラーはなく
Windows has scanned the file system and found no problems.
No further action is required.
と出て無問題。
ファイナル丸ごとバックアップから乗り換えようと思う

（もしかしたら、ファイナル丸ごとバックアップでも
　システムパーティションを復元対象にしていればエラー出ないのかもしれないが
　今更試すのが面倒）