普通は付いたままになるはず
何かべつの用途でで使用して、正規表現を使用しない設定に変更している気がする

秀丸起動時にマクロ自動起動させるのが良いかもしれないね（マクロ登録の自動起動）
マクロの中身は、setsearchで正規表現チェック