Q : ジェスチャミス後の右クリックメニューを出さないようにするには?

A : 設定にはないのでMouseGesture.ahk への改変が必要。

次の2行を「; ジェスチャー未発動の場合、トリガー操作をエミュレート」のあとに付け加えます。
If MG_Gesture <> %name%__
return

is not executed ・・・・・・595行目
; ジェスチャー未発動の場合、トリガー操作をエミュレート ・・・596行目
If MG_Gesture <> %name%__
return
CoordMode,Mouse,Screen
SetMouseDelay,-1
BlockInput,On
MouseGetPos,px,py
MouseMove,%MG_X%,%MG_Y%,0
GoSub,MG_%name%_Down
MouseMove,%px%,%py%,0
Sleep,1
GoSub,MG_%name%_Up
BlockInput,Off
}

GoSub, MG_%name%_Down
GoSub,MG_%name%_Up の処理が行われなくなるので結果として出なくなるはずです。