Q.「全板からスレッドタイトルで検索」で使うサイトを設定できないの？
A.不可能です。
「全板からスレッドタイトルで検索」の機能は検索リクエストを該当サイトに送って、
帰ってきたHTMLの内容をLive5ch内で解析してスレッド一覧に表示する機能です。
検索サイトは「専用ブラウザで表示するためのデータ」を送ってくれるわけではないのです。
「普通のWebブラウザ表示するためのHTML」を送ってくるのです。

つまり解析するためのコードをそれぞれのサイト毎に書かないといけないわけで、設定とかそういうレベルの話ではありません。
その上、サイト側の仕様変更、例えば改行の位置ひとつ変えただけ、配色一つ変えただけでも検索できなくなる可能性があります。

うだうだ言い訳しているけど
これに関してはgeroの認識orスキル不足

Linux向けの非公認専ブラでJDimってのがあるんだけど
URLと正規表現設定するだけで対応出来てるよ