>>728
どの辺が原因なのかなんとなく分かったけど再現出来ないですね
画像のポップアップウィンドウが出ない件もそうだけどウィンドウ周りはまだ不安定です

>>732
あれは未読 + 未取得レス数という表示になっています
どちらも表示すると冗長になってしまうと思い未取得の方は小さく表示させていますが
新着があるかどうかはタブの色でも判断できるので未取得の数は消せるような設定を追加するかも

>>734
今のところスレッドのメール欄のデフォルト値に設定する方法はないですが
レスする際のものと同じ値を入れた状態にするかもしれません

>>736
パネルアクションからオートロード切り替えというボタンを探してください

あとオートロードではないですがサイト編集の設定でスレッドを最後まで読んだとき板を
更新するにチェックを入れておくのを個人的におすすめしています