>>79のような使われ方をすることは作者も想定していないんじゃないか？
リッピングなしでただ単にwavから他フォーマットに変換したいだけなら上に書かれているようにfoobar等を使ったほうがいい
リッピング＋変換はEACでも特に問題なくできるよ
自分は何年もEACでリッピングとflac変換を行っているけど特にトラブルはないよ