スレッドとプロセスがごっちゃになってるぽい？
https://image.itmedia.co.jp/ait/articles/0503/12/dt-mthread01_02.gif

>555
exe（プロセス）を分けて動作が遅くなるっていうのは
色んなアプリを一度に立ち上げて動かしてたら1窓単体起動のときより重くなりましたつってるのと同じでは？
>556の言うように手動で任意のCPU割り当てる方法もあるけど
プロセス別のコア割り当ては基本OS側の仕事だと思う

同一プロセス内でのマルチスレッドについては
AHKは擬似マルチスレッドなのでマルチコア対応はしてないと思う