https://www.autohotkey.com/docs/commands/_Include.htm
マニュアル読み直してたらv1.1.28以降はErrorlevelとコマンドライン文字列以外のすべての組み込み変数が有効とあるね
Loop,Filesのローカル組み込み変数はどうなんだろ
もし使えるなら↓みたいにできるのかも(出先からのなので試してはいない)
#include %A_SprictDir%
Loop, Files, %A_SprictDir%\*.ahk, F
If (A_LoopFileFullPath != A_SprictFullPath)
#include %A_LoopFileName%