リストア時にリカバリーメディアをUEFIブートしてから実行したとかならあり得るんじゃないのかな？
それと、設定オプションにそうなる設定があるかも知れません
それから、MBRだとストレージ全体を復元時にマスターブートレコード領域の項目が出ませんか？