Romファイルと同フォルダにneogeo.zipを置いて、中にuni-bios_*_*.romがあることを確認(*はバージョン名)。

あとはOptionsから、
「Neo-Geo mode」を「Use bios specified in BIOS dipswitch below」に(無ければDipswitch)、
更にその下にある「BIOS」を「Universe BIOS ver *. *」に設定すればok(Rom毎に設定が必要)。

FB Alpha or FB Neoの場合。Mameは使ってないから分からん。