私はTab Mix Plus0.5.8.1を使っています
>>86さんの環境がわからないので言い切れないのですが重くもないし快適で設定は消えません
設定が書き換えられるということですが設定が残らない設定になってしまっているとか？
挙動がおかしいのなら再インストールしてみるとか？