確認が取れた
手順は以下の通り

01.猛将伝の内部ファイルを適当なフォルダに解凍する。これを仮にAフォルダと定義する
02.Aフォルダ直下に無印の解凍データの中から以下7つのファイルを配置する

SLPM_655.17
ATAD.IRX
DEV9.IRX
HDD.IRX
IOPRP300.IMG
MODULE.BIN
PFS.IRX

注1） SLPM_655.17は無印データの直下にあり、あとの6つは無印データ内のMODULESフォルダの下にある
注2）重ねて言うが、これらをAフォルダ直下に配置すること。直下でなければファイルのリネームを求められてしまう

03.全てのファイル配置を終えたAフォルダをISO化して完成
04.戦国1を起動し、結合を選んで「ISO」「ディスクなし」を交互に繰り返す

以上の手順でできるはずだ