DRM解除とPDF変換は別ステップなので
まずはどっちで失敗してるかを確認

またCalibreでのpdf変換は何かと鬼門で
アスペクト比狂ったり無駄に白紙ページが挟まったりしがち

https://manual.calibre-ebook.com/generated/en/ebook-convert.html
のPDFの項をよく読んで理解するか、別ツール使った方がいい