bunbackup（64bit）でAES暗号化をONにすると一部ファイル（10万のファイル中数件）ファイルが壊れるバグってある？

デスクトップ機→外付けHDDにミラーリング&暗号化していたんだが、ふとしたタイミングで一部の暗号化したファイルのサイズが小さくなっていることに気づきました。
暗号化をONにしていない設定の場合はそのようなことは起きていません。

デスクトップ機が外付けHDDやケーブルが壊れたかと思い、新しいノートと外付けSSDを購入して同じようにミラーリング&暗号化すると同様に一部のファイルが壊れていました。

bun backupが便利で他のソフトに変えられずにいるのですが、この問題は何らかの設定の問題でしょうか？