.mclファイルの件については、複数の.nnaファイルを同時に開いているとエラーが発生するようです。
あくまで想像ですが、複数の.nnaファイルからひとつの.mclファイルに書き込み要求が出されたとき、競合が発生してこのエラーが起きているのではないでしょうか？