Portable版ならまるごと移すだけでいいでしょ
なんのためのPortableなんだよｗ
AppDataとLibraryだけじゃ設定全部移せないぞ

それと移すだけなのでいちいち新規インスコはするまでもないが
一応言っておくと新規インスコした場合初回起動した時にいきなりファイルをスキャンしちゃ駄目
先に設定済ませておかないとタグがとんでもないことになる場合がある
特にデフォルトで強制的にチェックがオンになってるとこは要注意

ちなみに、MBは上書きするとフィールドが重複するバグがあるのでやらない方がいい
やるならエクスポートした設定ファイルをインポートしたあとファイルを1つづつ上書きすると比較的問題は起きにくい
一番安全なのは同期できるソフトを使って処理するといい
なので単純なコピペで済まそうとするのはおすすめしない