>>50
vivaldiに設定は（当方が探した限りでは）無いようなので、
chromeの拡張機能を追加するという方法があるようです。

No Smooth Scrolling
https://chrome.google.com/webstore/detail/no-smooth-scrolling/oikddacoldignalphkgeppnpalkmkgbo

オートスクロールの無効化オプション要望スレッドもありました
https://forum.vivaldi.net/topic/17474/need-an-option-to-disable-mouse-middle-button-auto-scroll

また、これは実用的ではないですが、Linux版のvivaldiにはオートスクロール機能が実装されていないので、
Linuxを使うとオートスクロール無しのvivaldiになります。余談でした。