起動オプション - Google Chrome まとめWiki
http://chrome.half-moon.org/43.html

上記を見た上で取捨選択してくれ。
なおちゃんと自分の環境に合わせてな？ただコピペなんてするなよ。
[ "C:\\Program Files\\Google\\Chrome\\Application\\chrome.exe", "-app=%s", "-incognito", "-disable-extensions" ]

なおFireFox
[ "C:\\Program Files\\Mozilla Firefox\\firefox.exe", "%s" ]