wavってフォーマット上タグ付け非対応で、iTunesやXアプリとか管理ソフト上でタグ付けできてるのは、それぞれ独自にDB作ってwavとタグ情報紐付けしてるから。
ファイル自体に埋め込んでるわけじゃない。

非可逆圧縮しないでタグ付けしたいならFLACかAIFFにするといいかと。