jane2ch.brdファイルを削除してctrl+板一覧の更新で新規に作り直せばゴミ設定は消えるさ
ただし、ログフォルダの下の各フォルダも調整しないと（板一覧から消えたゴミと化した板の）溜めてた過去ログが見えなくなる
宙ぶらりんの何処からもアクセスしないゴミフォルダ（とdat）になってしまったものを探すには
板覧-ログフォルダのチェック
で、トレースに表示される