システムリストアする際には、不正コピーをさせないためにマイクロソフトに配慮している模様です
そのために、ライセンス認証保存ファイルは復元しないようにしているので、
プロダクトキーが間違いなくインストールされているのなら
slmgr -atoでライセンス認証されると思います
それか、ネットに繋いでいないのでしたらライセンス認証はされませんね
また、プロダクトキーがインストールされていないようでしたら
slmgr -ipk "プロダクトキー" でインストールしてからじゃないとライセンス認証されませんね