Ｑ３．「AviUtl」の読み方は？
Ａ３．作者のKENくん氏いわく、「エーブイアイユーティルですが、好きに読んでもらって構いません」とのこと。

Ｑ４．シークしたりエンコしたりすると、途中の音やフレームが冒頭とか変なところに入ることがあるんだけど？
Ａ４．ファイルをAviUtl本体（拡張編集タイムラインでは駄目）に読み込んでみて、
　　　「その他→ファイル情報」で「ファイル制御」が「DirectShow File Reader」になってたら、それが原因。
　　　Ｑ１を参考にしてなるべく別の入力プラグインで読み込むこと。