重いのは3つ位の要因の複合的なものの様な気がしてる

1. 5ch鯖の問題
　　→裏で新鯖構築＆移行とかしてるだろうし、仮想鯖とかならCPU/DISKリソース取られて
　　　その間は重くなったりするかも知れないし、ネットワーク経由のコピー等があれば
　　　ネットワークリソース不足で重くなるかも知れない
　　　また502 Bad Gatewayとか出てた事もあったので、一時的には設定ミス等もあったかも知れない
　　　でも時間帯で遅い気もするので、そもそも新鯖が非力だという可能性も

2. 4.00βの問題
　　→本スレにも書いてる人いたけど、ログ全量取得している可能性
　　　http://jbbs.shitaraba.net/bbs/read.cgi/internet/8173/1495718689/861

3. 3.xx→4.00β移行の問題
　　→3.xxフォルダへの新exe/dllファイル上書き、4.00βフォルダへの旧ini/dat/txt等の上書き等、
　　　旧環境から手間を掛けずに移行したいユーザーが各々で様々な操作を行い、良いか悪いかは別として
　　　結果的に開発サイドが予期していない状況が発生し、これが原因で動作遅延が発生している可能性

3に関しては、βとは言っても移行に関する注意書きもガイドラインも何もない状況だから、
例えここにも遅くなる原因があったとしても一方的にユーザーが悪いとは言えないとは思う
誰だって楽に移行したいしね