Live5ch上からやるなら削除したり追加したりして無理矢理並べ替えるしか無い
一時的な並べ替えなら単純にカラムタイトルクリックしてソートすりゃいいと思うけど

任意に並べ替えたいなら
favorite.ftdを手動で編集する手もあるけど
改行消したり増やしたり文字コード変更しちゃったりプログラム上で想定されていない
変ないじりかたするとぶっ壊す危険性もあるから、もしやるならそれを理解した上で