自分も悩まされてたけど、解決方法を見つけました。
下記のようなStylish用の補助アドオンを経由させれば、各スタイルが編集できます。
https://addons.mozilla.org/ja/firefox/addon/stylish-custom/
この補助アドオン自体は個人的に不要な機能が多いけど、
あくまでStylishを延命するためと割り切って入れることにしました。
# とは言え、Stylishが編集できないのは Firefox 55.0.3 だけで、
# どういうわけか Firefox Developer Edition 56.0b12 のほうは問題なく編集できてる。
