>>170だけどようやく直ったっぽい
すべて Iron Portable を終了させた状態での作業で、

>>171のとおりインストールフォルダ\Profile\Default\Extensions が空っぽだったら
中身をバックアップから書き戻すのは多分必要（各拡張機能の本体のようだし）

その上で、インストールフォルダ\Profile\Default\Secure Preferences もバックアップから上書き

そのあと Iron Portable を起動したら拡張機能の一覧に拡張機能が見事全て復活。よかった