セキュリティソフトやSmartScreenで引っかかってるのは
自己解凍rar自体で中身のLive2chが引っかかってるわけじゃないです。
気になる人はインストーラーなしのzip版とアーカイブの中身のLive2ch同一バイナリで、
zip版はなんも引っかからないはずなのでそれで確認できると思います。
だからzipファイルの解凍やファイルの移動が自分で出来るなら、
インストーラーなし版でアップデートすればいいかと思います。

それにしても自己解凍rarってそんなに引っかかるものなのか。
とりあえず以前の自己解凍cabに戻すべきかな。

それでもダウンロード数伸びるまではSmartScreenには引っかかるだろうし、
自己解凍cab自体に引っかかるセキュリティソフトもあるだろうけども。
電子署名は導入したいけどコストの問題がきつい。