>>395
最小の手数なら(ただし内容相違時の優先順位は無視)
USB-4TBの外付けハードディスクを[HDD]として
PC-A　→　[HDD]　コピー
PC-B　→　[HDD]　差分コピー (Robocopyなど)
[HDD]　→　PC-A　差分コピー (Robocopyなど)
[HDD]　→　PC-B　差分コピー (Robocopyなど)
USB-4TBで不足ならUSB-RAIDケースで16TBぐらい簡単にいける

差分ファイルだけ持ち歩くようにしようとするなら
上の手順を、テキストファイル(ファイル名：日時：サイズ)の連結併合操作で代用するか
MD5ハッシュファイルなどで代用するか
データベースをポータブルに出来るカタログ兼バックアップソフトにお任せするかになると思う

申し訳ないが自分は適切なソフトをあげられないので、誰かお願い