こういう風にMouseClick,M,,,,,Uを途中に挿入してしばらく使ってみようと思います。
ありがとうございます。

;ウィンドウ中央マウス
MButton & LButton::
WinGetActiveStats, t, wa, ha, xa, ya
MouseClick,M,,,,,U
if(xa=1200 and ya=50 and wa=1345 and ha=1500)
{